在已被徹底探索殆盡的世界里，名為“深淵”的大洞是碩果僅存的秘境。 這個深不見底、不知會延伸到何處的巨大垂直洞穴中，不僅棲息著各種稀奇古怪的生物，還沉睡著現今人類所做不出來的珍貴遺物。 “深淵”那處處充滿不可思議的神秘樣貌，吸引人們前仆后繼地前去冒險。漸漸地，大家開始將那些多次挑戰大洞的冒險者們稱為“探窟家”。 孤兒莉可住在興建于深淵四周的城鎮“奧斯”，她夢想著將來要成為像她母親一樣偉大的探窟家，并一解深淵之謎。 某天，她母親萊薩的白笛被人發現，讓莉可因此下定決心要潛入深淵的深處。她撿到的失憶機器人雷格，也為了尋找自己的記憶而決定與她同行。 莉可在深界四層被穿珠的毒給侵蝕折磨，拯救她的是名叫娜娜奇的慘劇終末。娜娜奇加入之后，三個人便繼續前往彭多爾多所在的深界五層冒險。在那里，他們遇見了一個自稱普魯修卡的女孩。由彭多爾多撫養長大的她對外界一無所知。普魯修...