海底小縱隊是一群活躍在海底的小小探險家，集結了巴克隊長（北極熊）、皮醫生（企鵝）、生物學家謝靈通（海獺）、攝像師達西西（臘腸狗）、機械工程師突突兔（兔子）、小隊中尉呱唧（小貓）和章教授（章魚）7名伙伴。在巴克隊長的帶領下，一直向著未知的海域不斷探索前進！巴克隊長和皮醫生為了送小章魚酷巴回家，結伴前往加勒比海。然而他們在途中遭遇了突發事件，必須穿過叢林，探索神秘的洞穴。在小縱隊其他隊員的支援下，他們展開了全新的探險之旅……