在火星發現的神秘箱子――“潘多拉魔盒”打開的瞬間，巨大的墻壁突然出現！故事由此開始。被稱為“天空之墻”的墻壁把日本列島分割為三部分，并由此誕生了各自的首都「東都」「西都」「北都」。 其中在“東都”有被稱為Smash的未確認生命體出現并暗中把人類逼入絕境。擋在Smash面前而出現的，是一位青年，其腰上戴著腰帶、 手上握著不可思議的瓶子 。「變身！」―― 青年天才物理學者變身為假面騎士Build，阻擋在Smash的面前！